Non mancano tuttavia alcuni svantaggi. Il gatto che vive in casa potrebbe essere frustrato se non può esplorare e graffiare e l'impossibilità di sfogare i suoi istinti genera stress nell'animale. La conseguenza potrebbe manifestarsi in problemi comportamentali come il rovinare i mobili o evitare di usare la lettiera.
I gatti domestici, sia quelli randagi che quelli familiari soprattutto nelle isole e nelle zone ristrette, creano enormi danni alla fauna selvatica locale. Uccidono uccelli, piccoli mammiferi, rettili, anfibi e tantissimi artropodi (come gli insetti).
Erba gatta e tiragraffi sono un valido aiuto per evitare che il gatto faccia danni in casa. Non si tratta, infatti, di semplici distrazioni ma di alternative "casalinghe" ad alcune esigenze caratteristiche del gatto. Se in casa, quindi, arriva un micio meglio attrezzarsi a dovere.
Mentre dorme con voi il gatto potrebbe leccarvi il viso come segno d'affetto, un'abitudine pericolosa se è affetto da malattie. Tra i rischi più frequenti, infatti, per gli uomini ci sono le zoonosi, le malattie trasmissibili dai vertebrati agli uomini e viceversa.
Nella realtà, i felini sono animali sociali e socievoli, che sviluppano un legame molto forte con i loro umani. Quindi stare da soli in casa è per loro un piccolo scotto da pagare. Ma per quanto è sostenibile? Secondo gli esperti, sarebbe meglio non lasciare un gatto adulto da solo per più di 24 ore.