La salmonellosi si manifesta come una gastroenterite acuta, con diarrea, Vomito, febbre, dolori addominali: ha decorso grave solo nei neonati, per i quali può essere anche mortale. Il Periodo di incubazione è di 12-48 ore, mentre quello di contagiosità è estremamente variabile (da diversi giorni a parecchie settimane).
Bambini, anziani e soggetti particolarmente debilitati possono accusare quadri clinici più gravi e manifestazioni extra-intestinali, come: polmonite, endocardite e pielonefrite. Se la Salmonella riesce a migrare nel circolo ematico, può causare batteriemia o infezioni focali a carico, per esempio, di ossa e meningi.
Si presentano nausea e dolore addominale crampiforme, subito seguiti da diarrea acquosa, febbre e vomito. I sintomi da Salmonella si risolvono in 1-4 giorni. In alcuni casi, i sintomi sono più gravi e durano a lungo. Molto tempo dopo la scomparsa dei sintomi, alcuni soggetti continuano a eliminare i batteri nelle feci.
Questo rischio è notevolmente abbattuto dal loro consumo cotto e dalla successiva conservazione in condizioni opportune degli alimenti che le contengono. Le alte temperature, infatti, uccidono i batteri presenti, incluse le salmonelle.
In genere, la malattia guarisce senza trattamento; la fase acuta della salmonellosi si risolve nel giro di 4-5 giorni, tuttavia in alcuni pazienti la febbre e l'emissione di feci ancora non del tutto formate possono persistere per 10-15 giorni.