Pain non riporta in vita Jiraiya perché il suo obiettivo era ucciderlo per eliminare una minaccia e non aveva motivo di resuscitarlo. Inoltre, la tecnica Gedō: Rinne Tensei no Jutsu (usata per resuscitare le persone) richiede un enorme dispendio di chakra e probabilmente la vita stessa dell'utilizzatore, come mostrato in seguito con Nagato.
Ragione ufficiale: Nagato aveva abbastanza chakra solo per far risorgere chi era morto da poco. Jiraiya era morto troppo tempo fa. Ragione vera: rilevanza della trama. Per una volta Kishi ha capito che alcune persone devono essere/restare morte perché abbia un impatto.
A parte i punti della storia, la ragione secondaria principale è l'intelligence di Pain. La strategia di Pain ha un difetto importante, ovvero Nagato deve rimanere vivo per controllare i corpi. Jiraiya l'ha capito, completando così il suo obiettivo.
A causa del genio naturale di uno dei suoi membri, Minato, Jiraiya suggerì a Minato che poteva essere il Bambino della Profezia e lo prese come apprendista. Minato lo ricordava ancora decenni dopo e, durante l'Attacco della Volpe a Nove Code, si formò una sua conclusione riguardo alla profezia.